Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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