Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mbd4Q9Z2D7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd4Q9Z2D7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd4Q9Z2D7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms