Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
D17h6s53eQ9Z1R4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
D17h6s53eQ9Z1R4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms