Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nek4Q9Z1J2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nek4Q9Z1J2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms