Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Skp2Q9Z0Z3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Skp2Q9Z0Z3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms