Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nup160Q9Z0W3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup160Q9Z0W3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup160Q9Z0W3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup160Q9Z0W3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms