Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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Clip2Q9Z0H8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Clip2Q9Z0H8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Clip2Q9Z0H8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Clip2Q9Z0H8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clip2Q9Z0H8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clip2Q9Z0H8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms