Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gbp2Q9Z0E6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbp2Q9Z0E6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms