Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stub1Q9WUD1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stub1Q9WUD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms