Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms