Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lemd3Q9WU40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lemd3Q9WU40 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lemd3Q9WU40 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms