Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn4Q9WU22 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptpn4Q9WU22 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms