Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrf1Q9WU00 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrf1Q9WU00 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms