Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp18Q9WTV6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp18Q9WTV6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms