Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l3Q9WTM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l3Q9WTM4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l3Q9WTM4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nfe2l3Q9WTM4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nfe2l3Q9WTM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nfe2l3Q9WTM4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms