Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam50bQ9WTJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam50bQ9WTJ8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam50bQ9WTJ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms