Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP18Q9UMW8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP18Q9UMW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP18Q9UMW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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