Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TapbpQ9R233 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TapbpQ9R233 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms