Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx6Q9R1R0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lhx6Q9R1R0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms