Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst4Q9R1I1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Chst4Q9R1I1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chst4Q9R1I1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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