Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrpxQ9R0M3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms