Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zeb2Q9R0G7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zeb2Q9R0G7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms