Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prkab1Q9R078 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prkab1Q9R078 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prkab1Q9R078 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms