Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsjQ9R014 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsjQ9R014 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsjQ9R014 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms