Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh2d3cQ9QZS8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms