Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ercc4Q9QZD4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc4Q9QZD4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms