Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rdh11Q9QYF1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rdh11Q9QYF1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh11Q9QYF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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