Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcl11aQ9QYE3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcl11aQ9QYE3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms