Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cnpy2Q9QXT0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnpy2Q9QXT0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms