Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cln8Q9QUK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cln8Q9QUK3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms