Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk1eQ9JMK2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csnk1eQ9JMK2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms