Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3b2Q9JME5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ap3b2Q9JME5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms