Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sfmbt1Q9JMD1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sfmbt1Q9JMD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms