Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gkap1Q9JMB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gkap1Q9JMB0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms