Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SacsQ9JLC8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SacsQ9JLC8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms