Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TefQ9JLC6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TefQ9JLC6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TefQ9JLC6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms