Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cnot9Q9JKY0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms