Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scamp4Q9JKV5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.2 ms