Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Habp4Q9JKS5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Habp4Q9JKS5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms