Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx5Q9JKQ4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Irx5Q9JKQ4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms