Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stx6Q9JKK1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Stx6Q9JKK1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms