Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rcan3Q9JKK0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rcan3Q9JKK0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms