Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ap3m1Q9JKC8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ap3m1Q9JKC8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms