Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ube2j1Q9JJZ4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube2j1Q9JJZ4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ube2j1Q9JJZ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube2j1Q9JJZ4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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