Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gfra4Q9JJT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gfra4Q9JJT2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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