Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG6

Tmem47, Transmembrane protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem47Q9JJG6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem47Q9JJG6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Tmem47Q9JJG6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem47Q9JJG6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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