Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnip1Q9JJ57 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Kcnip1Q9JJ57 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Kcnip1Q9JJ57 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnip1Q9JJ57 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Kcnip1Q9JJ57 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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