Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod3Q9JHJ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Tmod3Q9JHJ0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Tmod3Q9JHJ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Tmod3Q9JHJ0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Tmod3Q9JHJ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Tmod3Q9JHJ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmod3Q9JHJ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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