Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc9Q9JHI7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc9Q9JHI7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms