Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp6Q9ESX2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sp6Q9ESX2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sp6Q9ESX2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms